单病种住院医疗费结算，是指市医保中心与定点医院之间，对医保患者住院医疗费的一种结算方式，即对某种疾病或治疗方式，经过调查测算平均应该花多少钱，来确定一个比较客观的平均结算标准，超支不补，结余归医院所有。